膜的物理和化學性質由膜材料決定，膜在混合液中的抗污染能力與該材料有關。有研究表明膜的親水性對對抗污染能力有非常重要的影響。有機膜材料中有一部分是親水材料，如pan，大多數是疏水材料，如PVDF、PE、PS等。疏水有機材料在應用時必須進行親水性改造，由于改造工藝的差異，親水性的使用過程中流失速度加快。

另外，防止膜污染的能力與膜表面粗糙度、膜表面電荷、膜孔徑等有關。一般來說，可以選擇親水性更好的膜材料來改善膜表面的粗糙度，選擇混合液電位等膜材料和適當的膜孔直徑來改善膜污染防治能力。

無機膜就像陶瓷膜：以氧化鋁、碳化硅、氧化鈦、氧化鋯等為原料，在高溫下燒結，通量、強度和化學穩定性比有機膜更方便。

在MBR工藝中，曝氣的目的除了給微生物供氧外，上升的氣泡和隨之而來的擾動水流還可以清潔膜表面，防止泥漿聚集，從而保持膜流速的穩定。同時，氣泡和膜纖維碰撞產生的震顫作用在膜纖維之間產生摩擦，阻止有助于加速沉積物的脫落，緩解膜污染。空氣曝氣過多會減少沉積在膜表面的粒子粒徑，使濾網的結構更加緊密，從而增加膜過濾阻力。相反，曝光量太大會減弱擾動，污染會加重，所以要選擇適當的曝光量。

根據MBR膜污染的三階段理論，膜表面的污染形成需要一個過程。首先，污染物在膜表面吸附、沉積、聚集，使用間歇吸入的工作模式旨在通過周期性停止膜過濾。也就是說，由于曝氣和水流產生的剪切力，膜表面堆積的泥漿會從膜表面脫落，從而恢復膜的過濾性能。一般吸入時間越長，固體物質在膜表面積累的程度就越大。停止的時間越長，膜表面沉積的泥漿越多，膜過濾性能也能恢復得越多。原則上，應根據膜制造商的建議和實際工程操作，確定符合自身特性的運輸和停止交替方式。